ฟันผุไม่ได้เกิดจากแมงกินฟัน แต่เกิดจากเชื้อแบคทีเรีย Streptococcus mutans ซึ่งเป็นเชื้อแบคทีเรียหลักที่พบในคราบจุลินทรีย์และเป็นสาเหตุสำคัญของฟันผุ การรมควันหรือใช้ยาทาที่แก้มไม่สามารถช่วยรักษาฟันผุให้หายได้ เพราะแบคทีเรียไม่ใช่หนอนที่ชอนไชในฟันของเรา
โดยเมื่อแบคทีเรียเหล่านี้ย่อยสลายแป้งและน้ำตาลจากอาหาร จะสร้างกรดออกมาค่อย ๆ ทำลายเคลือบฟันและเนื้อฟัน จนทำให้เกิดรูผุ หากปล่อยไว้โดยไม่รักษา อาจลุกลามถึงโพรงประสาทฟัน ทำให้เกิดการอักเสบ ปวดฟันรุนแรง หรือติดเชื้อเป็นหนองได้
วิธีการรักษารอยโรคฟันผุ คือ การกรอเอาฟันผุออกแล้วใช้วัสดุอุดบูรณะเข้าไปในโพรงฟัน หรือหากฟันผุทะลุประสาทฟันแล้วจะต้องทำการรักษารากฟันร่วมด้วย
